NEB內(nèi)切酶的對照實驗怎么做
NEB內(nèi)切酶可提供210多種內(nèi)切酶,其中有130多種內(nèi)切酶為重組酶。重組技術(shù)的運用,使NEB能在提高內(nèi)切酶的純度及品質(zhì)的同時,削減生產(chǎn)費用。
加入酶之前將反應混合物混勻,可以用移液槍上下吹打或輕彈管壁,然后在離心機中快速離心。切忌振蕩混勻。
一般情況下,我們推薦使用5-10單位酶量/μgDNA,基因組DNA用10-20單位酶量消化1小時。入內(nèi)切酶的量應不超過總體積的10%,以避免甘油過量引起的星號活性。貯存液中的添加物和底物溶液中尚存的殘余物(會導致小體積反應出現(xiàn)問題。如果在切割底物DNA時遇到了問題,建議加入以下對照實驗:
1、酶切對照DNA(含有多個已知內(nèi)切酶切割位點的DNA,如LambdaDNA或腺病毒-2DNA),以檢測內(nèi)切酶的活性。
2、如果對照DNA能夠被切割而實驗中的底物DNA不能,可以將這兩種DNA混合在一起再進行酶切,以檢測實驗用的底物DNA中是否存在抑制反應的物質(zhì)。如果確實存在某種抑制因子(通常為鹽、EDTA或酚),則混合之后對照DNA也不能被切割。
3、當內(nèi)切酶在非zui適條件下使用時可能會產(chǎn)生星號活性。
4、可以通過以下方法降低星號活性:使用高保真(HF)內(nèi)切酶、縮短溫育時間、使用省時內(nèi)切酶或者增大反應體積。